一般认为肠道感染和精神心理障碍是肠易激综合征发病的重要因素。
肠易激综合征的患者，以便秘和腹痛为主者，每分钟3次的漫步频率是明显增加的。还有一个是精神方面的因素，心理应激对胃肠运动有明显的影响。
有研究发现，因症状而求医与有症状而不求医者相比，有更多的精神心理障碍。对应急反应更敏感和强烈。再有就是与感染有关越来越多的研究提示，部分患者肠易激综合症症状发生于肠道感染治愈之后。其发病与感染的严重性与应用抗生素的时间均有一定的相关性。
肠易激综合征中医学上属“泄泻”范畴。对于本病的病机，《素问·脏气法时论》云：“脾病者，虚则腹满肠鸣，飨泄食不化。”《景岳全书》又云：“泄泻之本, 无不由于脾胃，盖胃为水谷之海，而脾主运化……若饮食失节，起居不时，以致脾胃受伤，则水反为湿，谷反为滞，精华之气不能输化，乃致合污下降，而泻痢作矣”。由此可见，脾虚为泄泻的关键病机。
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